Мультфильм "Анастасия" начинает разворачиваться во время празднования 300-летия дома Романовых, когда на пороге усадьбы внезапно появляется колдун Распутин, насылающий неисчислимые бедствия на царскую семью и всю Россию. Вскоре в стране разгорается революция, и чтобы спасти Анастасию, юную дочку последнего российского императора Николая II, от смерти, её бабушка Мария Фёдоровна решает увезти внучку заграницу, однако, когда они забираются в уезжающий поезд, девочка поскальзывается и срывается с лестницы, падая на землю. Со дня разлуки Анастасии с бабушкой проходит десять лет, все из которых девушка провела в детском доме, не помня ни малейшей подробности из своего трагичного девства. Единственное, что хоть как-то связывает её с прошлым, это кулон, когда-то подаренный ей бабушкой. А тем временем, Мария Фёдоровна, пребывающая в Париже, объявляет большую награду тому, кто сумеет отыскать её внучку, и именно это приводит к девушке двух молодых людей, Владимира и Дмитрия. Кажется, теперь всё встаёт на свои места и у девушки появляется возможность воссоединиться с близкими. Но в этой истории ещё рано ставить точку, ведь разгневанный на семью Романовых Распутин вряд ли допустит столь благополучного поворота в судьбе Анастасии...